Ольга Дудченко
Ольга Дудченко є науковим співробітником та доценткою у Медичному коледжі Бейлора та Університеті Райса (США). Ольга є розробницею низки широко використовуваних інструментів для збирання геномів, включаючи 3D-DNA, що є автоматизованим конвеєром для використання високомолекулярних даних для збирання генетичних даних, та Juicebox Assembly Tools, системи для візуального дослідження високомолекулярних даних, яка надає інтерфейс «знайди і клікни» для використання теплових карт високомолекулярних даних, що допомогають виявити та виправити помилки під час складання геномів. Вона є співзасновницею DNA Zoo (www.dnazoo.org), консорціуму, який спрямований на сприяння збереженню природи шляхом швидкої генерації та випуску високоякісних геномічних ресурсів.
У 2019 році MIT Technology Review відзначив Ольгу Дудченко серед “Інноваторів до 35 років”. Сучасні апарати для секвенування генів працюють дуже швидко, зчитуючи ДНК арахісу, баклажана чи броненосця за два дні. Але те, що вони повертають, – це мільярди дезорганізованих фрагментів ДНК-коду. Ольга Дудченко допомогла зробити наступний крок – зібрати ці фрагменти у правильному порядку, щоб виявити справжній геном – швидше і дешевше.
Дудченко використовує Hi-C – метод, розроблений для вивчення того, як складаються хромосоми, та показати, які фрагменти ДНК лежать фізично близько один до одного. У поєднанні з методами та алгоритмами розробленими Дудченко, це дозволяє легко збирати геноми.
Наприкінці 2018 року Ольга та її колеги поділилися першими результатами ДНК-зоопарку, зокрема наскрізними хромосомними послідовностями для понад 50 видів, включаючи гепарда, червону панду та бразильського дикобраза. У світі, де зростає кількість вимираючих видів, ДНК-код цих видів може одного дня стати єдиним, що від них залишиться.
Попереду науковців чекає наступне завдання: описати геном кожного виду на Землі. ДНК-зоопарк (де Дудченка називають “головним зоокіпером”) щотижня публікує нові дані щодо результатів досліджень у цій сфері. “Здатність приймати обґрунтовані рішення може бути вирішальним фактором між виживанням і вимиранням виду”, – каже Ольга.
